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生物有機肥料，是指利用畜禽糞便、秸稈、農副產品和食品加工的廢棄物、有機垃圾以及城市污泥等，經過微生物發酵、腐熟和無害化處理后經過畜禽糞便處理設備或者一些特用的設備加工而成的肥料。

與普通有機肥相比，生物有機肥有以下優點：一是生物有機肥的有機質含量大于35%，氮磷鉀總含量大于6%，符合商品有機肥產品質量標準。二是生物有機肥含有大量的有益微生物代謝產物。三是生物有機肥的原料經過連續10～15d的高溫發酵后，原料中的病原微生物、害蟲及其蟲卵、雜草及雜草種子被大量殺死，減少病蟲草害來源。四是用微生物發酵制成的生物有機肥無異味，而且生產成本低，易于農戶接受和使用。

生物有機肥的作用效果

1、提高作物產量、改善作物品質。生物有機肥營養物質釋放緩慢，氮素多以銨根離子或氨基酸形式供給植物。

2、提高土壤肥力，改善土壤理化性狀。使用生物有機肥不僅能補充被消耗的有機肥料，而且還能不斷提高土壤有機質含量。

3、調節微生物區系，改善土壤微生態系統。腐熟的有機肥中含有酵母菌、乳酸菌、纖維素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有機肥還含有固氮菌、硅酸鹽細菌、溶磷菌、光合細菌和假單胞菌等一些有益菌，除了具有產生大量活性物質的能力外，還具有固氮、溶磷、解鉀等能力。

4、活化難溶化合物，提高土壤向供養能力。生物有機肥料中含有固氮微生物，該類微生物可通過其中固氮酶的作用將空氣中的氮還原為可被作物吸收利用的成份，是作物提供氮素營養的一條重要途徑。